由李遠哲主持的國政顧問團昨天召開第二次會議，確定由現任國防部長唐飛出任下任行政院長。至於原先屬意的國政顧問團首席顧問李遠哲，陳水扁在會後記者會表示，經過反覆思考如何才能對李遠哲最有利之後，決定尊重李遠哲的意願，請李遠哲繼續留任中研院院長，並將聘請他擔任總統府資政。在總統府中，設一間辦公室，提供「總統府最重要的資政之一李遠哲」辦公。

與陳水扁一同出席記者會的李遠哲說，經過多日思考，他自己覺得，留在中研院工作，所能發揮的社會功能也很高，而且，有比他更適合在全民政府、清流共治、穩定國家政局的大原則下出任閣揆的人才，那就是國防部長唐飛，因此，他決定留在學術界，繼續為國家服務。

李遠哲以中研院與國防部的多次接觸為例，高度推崇唐飛的學、經歷與能力。

陳水扁說，昨天，國政顧問團提供最後推薦的閣揆名單，基本上，最後名單是有二個人，其中之一是李遠哲。但經他反覆思考，對李遠哲最有利的是讓他留在中研院擔任院長，兼任總統府資政，在總統府內，他將提供一間辦公室，供李遠哲資政辦公，做為總統的最重要幕僚之一。

除此之外，陳水扁說，李遠哲並將籌組跨黨派小組，擔任召集人，除協助政府推動兩岸事務、學術發展與教育改革等外，並將繼續完成921大地震的災後重建工作，進行朝野協商、溝通等，為國家做更多的事。