陳定南尚未接任法務部長，已砲火四射。「陳青天」的新官三把火，看來不會是小火，但如真要燒向全國公務人員，全面建立公務員自清檔案，恐怕要有反被火燒的心理準備。我國採罪行法定主義，除非有確切證據認定犯罪，否則應推定無罪，也因此，像香港廉政公署的公務員有義務交代不明來源財產的肅貪措施，在台灣難以行得通。
如果要公務人員自白自清，勢必得先大費周章的修改法令。問題是過去遭詬病的公務員「忠誠資料」、調查局「ＡＢ」檔案等好不容易銷毀，現又要填寫自清檔案；雖然大多數公務員問心無愧，可坦然面對，但「白色恐怖」氣氛再現的反彈勢難避免。
陳定南的另一把火燒向調查局，他聲言要以大換血的方式撤換老調查員，重用新進調查員，雖可注入辦案活力，嚴防舊勢力與黑金掛鉤。但不要忘了：調查局這隻老虎張牙舞爪時，可是曾把「掃黑英雄」前法務部長廖正豪扯下台的。
肅貪、查賄、掃黑、緝毒的政績，過去成就馬英九、廖正豪在法務部長任內的威名；陳定南的清廉自持有目共睹，他肅貪、打擊犯罪的強烈企圖心也令人印象深刻。看得出來，他也亟欲超越前幾任部長的格局，開闢自己的戰場。但法務部雖然有掃黑、肅貪、查賄的舞台，政策要順利執行且見成效，則有待檢調大軍衝鋒陷陣，單憑部長一人的熱情，不僅事倍功半，部屬的陽奉陰違，將使所有的良法美意淪為空談。
法務部調查局及政風司內部的高層官員則低調表示，新部長還未完全了解調查局、政風單位的作業特性和績效，他們會向新部長提出完整報告。
部分資深調查員對新部長的質疑，憤怒地表示，還好他們是國家的調查員，人民的調查員，否則心情不知如何調適以人事升遷為例，調查員受限於組織條例，調查員的升遷早已阻塞不通，有六成的調查員大都在八職等原地踏步多年而無缺可升，這六成調查員在調查局都有十餘年的經歷，是調查局目前辦案的主力。
一位資深調查員說，誰說他們沒有理想他們就是為摘奸發伏才考入調查局。誰說他們沒有熱血已經四十歲了，偵辦政治偵防案，跟監不敢跟丟人，騎機車冒死闖紅燈，飆高速公路。辦走私案，寒冬在海邊徹夜守候辦貪瀆案，拋家棄子在棄土場旁數著一車車的廢土。誰說他們沒有抱負接獲命令，沒有身分就到海外工作，只為了國家安全一句話。
調查員指出，有些調查員因風紀不好而受外界指責，但調查局的調查員近兩千人，外界不能以偏概全，完全否定所有調查員的操守。工作已經很繁重了，還要受外界質疑，搞得他們身心疲累。
肅貪另一支柱的政風人員也表示，他們與以前的「人二」人員不一樣，工作上也無所謂人情包袱。法務部政風司官員說，現在的政風人員素質不差，依人事行政局統計，全國公務人員有百分之八十三的學歷是大專以上，而政風人員則有百分之八十八是大專學歷，比全國公務員水準還高，況且目前招考的政風人員班，有近七成是大學法律系畢業。政風司也採任期制、訂定升遷序列，避免政風人員與單位關係過於密切。
部分政風人員說，政風工作真正要做的是預防工作，不能光拿查處的績效來評斷政風業務，要做公務員不貪汙，就應效法外國體制，落實陽光法案。政風人員說，肅貪是救火，但政風工作是防火的工作，外界不能光「以救火是英雄，防火就不是英雄」的心態來論斷政風人員。有些政風人員更不滿績效差的評議，表示政風人員沒有調查權，如果有調查權，也會有「血淋淋」的績效。
對新部長打算將政風人員撤出政府機關，在仿調查站形式在外另成立機構，基層政風人員頗不以為然地說，把政風人員撤出，光從外部去了解機關貪瀆，屆時如何去發現線索對於新部長批評肅貪、政風單位的作法，多位政風司官員不滿地說，他們老早就有心理準備，如果能做，就做如果不能做，就乾脆裁掉。三千多名的政風人員能轉換到其他公務機關，未嘗不是件好事。
姚士鵬強調，調查人員是服從性和自制性甚高的國家人馬，絕對尊重法務部的指揮監督雖然說合理要求是訓練，不合理要求是磨練，但如果上級長官一味打壓，無異是否定調查局過去對國家的努力，因此他們希望陳定南能以鼓勵代替苛責。
內定法務部長的陳定南，尚未走馬上任，最近發表一些談話對調查局、政風單位多所批評，引起基層調查人員的不滿。昨天傳出陳定南有關「調查局可考慮裁撤」的說法，更招致調查局全面的反彈。
（二）調查局廉政處、洗錢、經濟、緝毒犯罪防制中心，以及相關的資訊、情資單位，都是奉行政院核定，有命令依據的任務編組，不是「黑機關」。
（三）至於政治偵防工作，自始至終都是由國安局督導，由調查局負責執行。其中緣由除了因為國安局是行政機關，有將無兵且調查局執行政治偵防的經驗豐富，如果將調查局這項重要任務解除，將置國家安全於何地。沒有國家安全，毋庸論及社會安定和經濟繁榮。
陳定南未上任為政而多言，不知謀定而後動，招致強烈反彈質疑的尷尬，當然與個人的個性和風格有關。對調查員來說，「換血」無異官位乃至飯碗不保的敏感說辭，而「裁撤」或一化為三的「功能說」，也擺明了準部長要來「拆招牌」。這些組織定位、功能調整、編制重劃都還沒一撇，就操之過急要銳意改革，甚至要人事、機關大掃除，當然讓當事人有是可忍孰不可忍的情緒。
平實而論，陳定南的改革規劃若有整體配套，是值得討論的。只是，「陳青天」的性急與直率，對解決這般偌大的問題非但無所助益，反可能衍生掣肘而平添困難。再說，改革工程涉及整體國家安全、情治、調查與警政事務龐大與機關牽扯，也實非法務部長一人能夠定奪。因此，要調查局變成專業化、功能化單位，務必整體審慎配套。
在政權移轉之際，國人對法治清明期待甚殷，重新依民主制衡原則整體規劃、調整情治系統，確屬良機。但權責不單是法務部或行政院，還攸關直屬總統府的國安局。如何協調，清楚定位各機關職掌、功能和任務，讓調查局確能如陳水扁所言成為國家級調查局而又如何能祛除治安、情治不分的尷尬，確如陳定南所言成為更專業化機構，這些都要配套修法徹底釐清。因此，面對調查局的反彈，新部長務要尋思更佳的領導統御藝術了。