雲林縣古坑鄉草嶺風景區清水溪，震災造成嚴重阻塞，形成新的「草嶺潭」，危及下游林內鄉，甚至台塑六輕安全，情勢岌岌可危，經濟部第四河川局人員上山觀測後表示，若未逢風災豪雨，二、三周沒有立即危險，但集水區上游居民要立即疏散。

草嶺風景區清水溪遭受強震，地層滑動、土石掉落，清水溪遭嚴重阻塞，經濟部第四河川局副局長謝錫欽說，清水溪阻塞長達五公里，上游河道阻塞五十公尺、下游二百五十公尺，河川局工程技師搭直升機上山設觀測站，調查土方總量共二千五百萬立方公尺。